Men heeft bij herstelwerkzaamheden aan de fundamenten van de kerk enkele malen sporen van houten boomstamkisten gevonden. De fundamenten van de kerk waren er keurig in een boogje overheen gemetseld, een bewijs dat deze boomzerken van een hoge ouderdom zijn. Een van deze boomzerken is nog steeds te bezichtigen in museum "Het Domein".
Velen vonden rondom de St.Petruskerk hun laatste rustplaats tot het jaar 1839. In dat jaar was ruimtegebrek er de oorzaak van dat er een nieuw kerkhof zou komen. Op stadskosten werd een nieuwe algemene begraafplaats aangelegd in de nabijheid van de Begijnenhofstraat, een terrein dat vroeger behoord had tot de eigendommen van het Begijnhof. Om een betere toegang tot deze begraafplaats te krijgen werd een gedeelte van de wal afgegraven op de plaats, waar de wal thans gekruist wordt door de Deken Tijssenstraat.Andere verhalen over dit onderwerp:St.-Petruskerk, Kerkhof, Kerk en Geloof.